Родился 20 марта 1910 года в г.Егорьевске Московской области. В 1926 году окончил школу фабрично-заводского ученичества (ФЗУ), работал подмастерьем на ткацкой фабрике. Поступил в Московский текстильный техникум, но проучился только до 3-го курса. В 1932 году направлен в Ленинградскую военно-теоретическую школу лётчиков, а затем учился в Энгельской школе военных лётчиков. В звании лейтенанта служил старшим лётчиком в 119-й истребительной авиационной эскадрильи (95-я Бакинская истребительная авиационная бригада, Закавказский военный округ).

Участник гражданской войны в Испании с 31 мая по 15 ноября 1937 года. Летал на И-15 в составе 1-й авиационной эскадрильи. Совершил более 120 боевых вылетов, в том числе 8 ночных. Провёл 25 воздушных боёв, сбил 6 самолётов лично и 2 в составе группы. Первый пилот, сбивший самолёт противника в ночном бою (26 июля 1937 года). Награждён двумя орденами Красного Знамени.

В июне 1938 года в составе группы из 10 истребителей И-15бис капитан М.Н.Якушин направлен для оказания помощи народу Китайской республики в борьбе с японскими захватчиками. После возвращения из Китая в 1939 году получил звание майора. Принимал участие в Советско-Финляндской войне, награждён третьим орденом Красного Знамени. В предвоенные годы участвовал в московских авиационных парадах в составе "красной пятёрки" истребителей И-16.

 С 22 июня 1941 года майор М.Н.Якушин на фронтах Великой Отечественной войны. В июле 1941 года назначен  начальником Восточного сектора ПВО Москвы, затем был заместителем командующего 6-м истребительным авиационным корпусом ПВО. В 1942 году возглавлял отдел истребительной авиации Лётной инспекции ВВС КА. С 24 февраля 1943 года (после гибели дважды Героя Советского Союза генерал-лейтенанта авиации Г.П.Кравченко) полковник М.Н.Якушин командовал 215-й истребительной авиационной дивизией. За годы Великой Отечественной войны выполнил 13 боевых вылетов.

После окончания войны продолжил службу в авиации, был руководителем учебного центра в Липецке. Участвовал в войне в Корее, был авиационным советником китайских ВВС. В 1953 году присвоенно воинское звание "генерал-майор авиации". Вышел в отставку в звании генерал-лейтенанта авиации. Жил в Москве. Умер 5 июля 1999 года.

Награждён орденами: Ленина (29.05.1945г.), Красного Знамени (31.07.1937г; 22.10.1937г.; 07.05.1940г.), Кутузова 2-й степени (25.07.1944г; 10.04.1945г.), медалью "За боевые заслуги" (03.11.1944г.), польскими орденами Крест Грюнвальда 3-го класса и Крест Храбрых, российским орденом Жукова (07.11.1995г.).