Служил в составе 60 скоростного бомбардировочного авиаполка.

Полк участвовал в Советско-финляндской войне.

В 1941г. проходил перевооружение с самолетов Р-Z на Пе-2. Находился в составе Харьковского военного округа.

В средине июля 1941г. личный состав полка после напряженной боевой работы, потеряв при выполнении боевых заданий почти все имевшиеся на вооружении самолеты, был направлен в Москву.

С 21 июля 1941г. началось формирование 2 авиационного полка дальней разведки. Несколько экипажей 60 скоростного бомбардировочного авиаполка были направлены в формирующийся полк.

На вооружении полк имел самолеты Пе-2 и Пе-3. Базировался на аэродроме Монино. Командир полка- подполковник Тюрин Трофим Романович.

Алексей Степанович был назначен техником авиационного звена 3-й авиаэскадрильи полка.

Командиром эскадрильи был капитан Климанов Алексей Иванович. Когда он вместе со штурманом эскадрильи капитаном Политыкиным Василием Константиновичем не вернулся с боевого вылета 14 декабря 1941г., командиром эскадрильи был назначен капитан Дмитриев Павел Дмитриевич.

В начале 1942г. на базе 3 авиаэскадрильи была создана оперативная группа полка. Аэродром оперативной группы, действовавшей на Северо-Западном (Ленинградском) фронте, находился в районе Валдая. Командовал группой капитан Дмитриев.

Указом Президиума ВС СССР от 20 июня 1942г. старший техник-лейтенант Трошанин был награжден медалью «За боевые заслуги».

Награжден медалью «За оборону Москвы».

К концу января 1943г. технический состав звена под руководством Алексея Степановича подготовил самолеты к 315 боевым и к 215 учебно-тренировочным вылетам.

В течение 3 месяцев Алексей Степанович исполнял обязанности старшего техника эскадрильи. За этот период эскадрильей выполнено 112 боевых вылетов на дальнюю разведку.

Старший техник-лейтенант Трошанин был представлен к ордену Красной Звезды, приказ о награждении от 22 февраля 1943г.

08 февраля 1943г. полк был преобразован в 47 гвардейский авиационный полк дальних разведчиков.

Командиром 3 авиаэскадрильи был назначен гвардии капитан Малютин Михаил Васильевич.

В апреле 1944г. Алексей Степанович находился на излечении в эвакогоспитале ЭГ 2013. 30 апреля выписан и направлен в полк.

К концу войну под руководством гвардии старшего техник-лейтенанта Трошанина самолеты звена были подготовлены к 778 успешным боевым и 945 тренировочным вылетам, заменены 52 авиамотора, поднято на местах вынужденных посадок 9 самолетов, посаженных на фюзеляж, проведено 10 восстановительных ремонтов.   

Приказом от 08 июня 1945г. Алексей Степанович был награжден орденом Отечественной войны II степени.

Награжден медалями «За взятие Кенигсберга», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

За долголетнюю и безупречную службу в ноябре 1945г. был награжден медалью «За боевые заслуги», в 1950г.- орденом Красной Звезды, в 1956г.- орденом Красного Знамени.

Гвардии майор технической службы Трошанин вышел в отставку 01 декабря 1961г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны II степени.