Серафим Субботин родился в деревне Красногорье ныне Первомайского района Ярославской области в семье крестьянина-бедняка в 1921 году. В 1933 году вместе с семьёй переехал в город Любим. Окончил 9 классов средней школы. В 1938 году вступил в Красную Армию. Выпускник Тамбовского Краснознамённого кавалерийского училища (1940) и Ульяновской военной авиационной школы пилотов (1942), в которой остался инструктором. 1942 г.  

С сентября 1943 года - командир звена 4-го запасного авиационного полка Приволжского военного округа. С марта 1946 года служил в 176-м Гвардейском ИАП. С июня 1948 года - помощник штурмана 176-го Гвардейского ИАП, с ноября 1950 года - штурман 176-го Гвардейского ИАП. В составе этого же полка в декабре 1950 года убыл в правительственную командировку в КНР, где в качестве старшего штурмана 176-го Гвардейского ИАП принимал участие в оказании интернациональной помощи народам КНР и в период войны на Корейском полуострове в 1950-1953 гг. За период с апреля 1951 года по февраль 1952 года совершил около 100 боевых вылетов, провёл 48 воздушных боёв, в которых лично сбил 9 самолётов противника. 10 октября 1951 года штурман 176-го Гвардейского ИАП майор С. П. Субботин удостоен звания Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали "Золотая Звезда".

С августа 1952 года - помощник командира 176-го Гвардейского ИАП по тактике воздушного боя и воздушной стрельбе. В сентябре 1952 года убыл на учёбу в Монино. В 1956 году окончил командный факультет Военно-Воздушной академии. Служил в войсках ПВО на командных должностях. С ноября 1956 года командовал 66-м ИАП (238-я ИАД). Затем был командиром дивизии, закончил службу на должности заместителя начальника штаба ИАК ПВО в Заполярье. За время службы в авиации освоил следующие типы самолётов: У-2, УТ-2, И-16, Як-1, Як-3, Як-12, Як-15, Ла-5, Ла-7, Ла-9, МиГ-15, МиГ-17. С августа 1973 года Гвардии полковник С. П. Субботин в запасе. Проживал в городе Черкассы (Украина). Умер 22 апреля 1996 года.

Вернувшись в СССР, продолжил службу в авиации. В 1956 году окончил Военно - Воздушную академию. Служил в войсках ПВО. С 1973 года Полковник С. П. Субботин - в запасе. Жил и работал в городе Черкассы. Умер 19 Апреля 1996 года.

Награды: медаль "За боевые заслуги" (20.06.1949 г. - за выслугу лет), орден Красного Знамени (02.06.1951 г. - за бои в Корее), медаль "Золотая Звезда" № 9289 (10.10.1951 г. - за бои в Корее), орден Ленина (10.10.1951 г. - со званием Героя Советского Союза), орден Красной Звезды (03.11.1953 г. - за налёт на реактивных самолётах), орден Красной Звезды (22.02.1968 г. - за отличную службу), другие медали.