С октября 1943г. в составе 98 отдельного гвардейского разведывательного авиационного полка. Командир полка Артемьев Борис Павлович. 

Летчик 3 авиаэскадрильи полка. Командир эскадрильи- Герой Советского Союза гвардии майор Конкин Михаил Парфентьевич. На вооружении эскадрильи стояли американские истребители Р-39 «Аэрокобра», позже, поступили Як-9.

29 марта 1944г. четверка самолетов «Аэрокобра»- летчики: заместитель командира эскадрильи гвардии капитан Сачков Виктор Петрович, младший лейтенант Стогов, старший лейтенант Некрасов Александр Иванович и младший лейтенант Мартынов Евгений Васильевич, вылетев с аэродрома Тирановка- выполнила разведку районов Тарнаполь- Золочев. Продолжительность вылета 1ч 13 мин.

31 марта пара Некрасов- Стогов выполнила разведку районов Тарнаполь- Буск- Соколовка- Броды. В районе Зворов была атакована парой истребителей противника. Ушла в облачность.

08 апреля пара гвардии капитан Поволокин Захар Иванович, Стогов выполнила разведку районов Плусте- Бучач- Цаповце.

В апреле 1944г. командование эскадрильи принял- гвардии капитан Сачков Виктор Петрович.

15 апреля пара гвардии старший лейтенант Юркин Николай Иванович, Стогов, вылетев с аэродрома Ровно,  выполнила разведку районов Красне- Каменка- Соколь

16 апреля пара Мартынов- Стогов выполнила разведку районов Броды, Красне, Радзехув.

17 апреля пара Юркин- Стогов выполнила разведку районов Жульков- Львов- Красне- Броды.

18 апреля пара Некрасов- Стогов из-за несогласованных действий в воздухе, не выполнила задание на разведку.

22 апреля пара Некрасов- Стогов, вылетев с аэродрома Соловье, выполнила разведку районов Радзехув- Буск- Броды.

23 апреля- в районах Подгайцы- Бережаны- Золочев.

24 апреля пара Мартынов- Стогов из-за плохих метеоусловий не смогла выполнить задание. 

25 апреля пара Поволокин- Стогов выполнила разведку районов Торчин- Владимир-Волынский- Соколь.

30 апреля пара гвардии младший лейтенант Лезжов Иван Иванович, Стогов выполнила разведку районов Торчин- Владимир-Волынский- Радзехув.

Вторым вылетом пара из-за низкой видимости частично выполнила задание по разведке районов Владимир-Волынский- Грубешув- Соколь.

30 апреля 1944г. младший лейтенант Стогов был представлен к ордену Красного Знамени. Приказом от 15 августа 1944г. был награжден орденом Красной Звезды.

01 мая пара Лезжов- Стогов выполнила разведку районов Торчин- Владимир-Волынский- Кристинополь.

Вторым вылетом из-за плохих метеоусловий задание на разведку выполнила частично.

02 мая пара младший лейтенант Гущин Юрий Васильевич, Стогов- выполнила разведку районов Броды- Львов.

05 мая пара Гущин- Стогов выполнила разведку районов Броды- Львов.

Вторым вылетом выполнила разведку районов Подгайцы- Монастыриска- Бугач- Язловец.

06 мая- районов Бережаны- Подгайцы- Монастыриска- Бугач. Обстреляны зенитной артиллерией.

10 мая пара Мартынов- Стогов выполнила разведку районов Соколь- Кристинополь- Каменка.

В тот же день, 10 мая, пара Гущин- Стогов вылетела в район Подгайцы. В 30км. юго-западнее Тарнаполя была атакована  парой истребителей ФВ-190 (Фокке-Вульф). В воздушном бою самолет ведомого Стогова был подожжен. Борис Алексеевич получил ранения головы и челюсти.

После госпиталя вернулся в полк.

05 октября 1944г. командиром полка был назначен гвардии подполковник Звонцов Федор Федорович.

К 08 февраля 1945г. гвардии младший лейтенант Стогов совершил 56 успешных боевых вылетов. Вел разведку в районах Тарнув, Краков, Кельцы, Радом, Томашув и др. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 10 апреля 1945г.

К 13 апреля совершил 96 успешных боевых вылетов. Вел разведку рубежей обороны противника вдоль берегов рек Висла, Нейссе, Шпрее. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 12 мая 1945г.

За время войны гвардии лейтенант Стогов совершил 109 успешных боевых вылетов на разведку. Приказом от 12 июня 1945г. был награжден орденом Отечественной войны II степени.

Награжден медалями «За взятие Берлина», «За освобождение Праги», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

За долголетнюю и безупречную службу в 1951г. награжден медалью «За боевые заслуги», в 1954г.- орденом Красной Звезды.

Гвардии капитан Стогов был уволен в запас 26 декабря 1956г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны I степени.