Родился в селе Лифляндии Приморского края (ныне это г. Большой Камень). Перед войной призван в Красную Армию. Проходил службу в районе Комсомольска-на-Амуре в войсках Дальневосточного военного округа. Т.к. был этническим эстонцем, во время войны его перевели в национальную 7-ю стрелковую дивизию, скомплектованную из уроженцев Прибалтики. Принимал участие в боевых действиях в войне с Германией с июня 1943 по февраль 1944 года рядовым в составе 354 стрелкового полка. Участвовал в битве под Великими Луками на Калининском фронте, с января 1944 года - на  Ленинградском фронте, где был контужен.

Затем 7-ая стрелковая дивизия была переведена  в состав 2-го Прибалтийского фронта для участия в боях против Курляндской группировки. Победу Шоберг Г.М. встретил в Прибалтике, ему было 24 года. В 1945 году дивизия, где он служил, была переименована в 118-ю гвардейскую Эстонскую стрелковую Таллиннскую Краснознамённую дивизию. Из его наград военного времени известна лишь медаль «За победу над Германией». Ещё есть юбилейные награды. В народном музее колхоза «Новый Мир» в г. Большой Камень хранится письмо, которое прислало командование демобилизованному гвардии сержанту Герману Шобергу. Письмо подписано известным советским военным деятелем генерал-майором Иоганом Ломбаком.