Служил в составе 57 бомбардировочного авиаполка, базировавшегося на аэродроме Чернышовка в Приморье. Полк имел на вооружении самолеты СБ.

С 06 июля 1941г. полк начал перелет на аэродром Сасово (Рязанская обл.). В конце июля в Сасово полк был переформирован в два полка. 1-я и 2-я авиаэскадрильи составили 57 «А» скоростной бомбардировочный авиаполк (командир полка майор Суржин Иван Семенович, помощник командира полка- старший лейтенант Кожевников Василий Дмитриевич).

22 августа полк вошел в составе 10 смешанной авиадивизии. На вооружении имел 15 самолетов СБ.

31 августа Василий Алексеевич участвовал в воздушном бою в районе Ивочкино- Михайловка (Смоленская обл.). Огнем пулемета не дал возможности истребителям Ме-109 (Мессершмитт) атаковать свой самолет.

В период с 09 августа по 11 сентября воздушный стрелок-радист старший сержант Семенов совершил 18 боевых вылетов. 14 сентября 1941г. был представлен к ордену Красной Звезды (*в наградном листе записан как Семенов Василий Александрович). Приказ о награждении от 23 ноября 1941г.

29 сентября 1941г. полк был переименован в 450 скоростной бомбардировочный авиаполк. В составе полка осталось 5 исправных самолета и 4- требующих ремонта.

04 октября 1941г. полк направлен на аэродром Козельск.

К 13 октября полк имел  1 исправный самолет и 1 неисправный.

В составе полка Василий Алексеевич совершил 28 боевых вылетов.

15 октября 1941г. личный состав полка направлен в г.Чкалов на доукомплектование и переучивание на самолет Пе-2. 

В мае 1942г. полк расформирован, командование и летный состав были переданы в состав формировавшегося 4 дальнего разведывательного авиационного полка (командир- майор Берман Семен Давидович, военком- батальонный комиссар Артемьев Борис Павлович). На вооружении полк имел самолеты Пе-2, Пе-3, впоследствии,  американские самолеты «Аэрокобра».

Василий Алексеевич зачислен в состав 2-ой авиаэскадрилья полка (командир эскадрильи старший лейтенант Колодяжный Сергей Амвросиевич). 

На базе эскадрильи была сформирована оперативная группа полка, которая действовала с оперативного аэродрома Добринка (Тамбовская обл.) в интересах Юго-Западного и Степного фронтов. В 1942г. группой руководил старший лейтенант Гаврилов Дмитрий Дмитриевич.

Экипаж самолета Пе-2 летчик Николаенко Владимир Миронович, летнаб (летчик-наблюдатель) Юрьев Леонид Васильевич, стрелок-радист Семенов Василий Алексеевич, механик авиационный старший Журавлев Артемий Васильевич, механик авиационный Сергеев Александр Кузьмич, моторист авиационный Киряков Иван Сергеевич.

В январе 1943г. командование полком принял подполковник Артемьев Борис Павлович.

К январю 1943г. сержант Семенов совершил 20 успешных боевых вылетов на разведку. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказом от 28 января 1943г. награжден орденом Отечественной войны II степени.

Награжден медалью «За оборону Сталинграда».

В июне 1943г. полк был преобразован в 98 отдельный гвардейский разведывательный авиаполк.