С 1941г. служил авиационным механиком в Мелитопольской военной авиационной школе стрелков-бомбардиров (с сентября 1941г. находилась в эвакуации в Саратовской области).

12 октября 1942г. прибыл в состав 952 штурмового авиаполка.

Будучи авиамехаником, подготовил самолеты Ил-2 к 63 боевым и к 392 учебно-тренировочным вылетам, которые прошли успешно.

К концу октября 1944г. также выполнил 14 успешных боевых вылетов в качестве воздушного стрелка.

Приказом от 06 ноября 1944г. сержант Савинов был награжден орденом Славы III степени.

Служил в составе 2 авиаэскадрильи полка. Командир эскадрильи старший лейтенант Андреев Борис Александрович.

Полк базировался на аэродроме Калвария.

13 января 1945г. началось наступление наших войск. Части 3 Белорусского фронта прорывали оборону противника на границе Восточной Пруссии, нанеся основной удар на Шталлупенском направлении (Шталлупен- совр. г.Нестеров, Калининградская обл.).

05 февраля полк перебазировался на аэродром Гарадуен, Восточная Пруссия (совр. пос.Железнодорожный, Калининградская обл.).

К концу марта Евгений Яковлевич совершил 34 успешных боевых вылетов. Приказом от 06 апреля 1945г. награжден орденом Красной Звезды.

Последний боевой вылет экипажи полка совершили 08 мая 1945г. в район севернее г.Тигенхоф, Восточная Пруссия (совр. Новы-Двур-Гданьский, Польша).

Старший сержант Савинов был награжден медалями «За взятие Кенигсберга», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».