03.07.1941 мобилизован в ряды ВМФ и проходил службу командиром сторожевого катера СКА-519 4-го дивизиона СКА Иоканского военно-морской базы Беломорской военной флотилии.

С 30 ноября 1944 - командиром сторожевого катера #501"Ара" Карской военно-морской базы Беломорской военной флотилии.

С 14 апреля 1945 командиром броне катера БК-335 1-ой Керченской Краснознаменной бригады речных кораблей Краснознаменной Дунай кой флотилии.

Последнее место службы с 31 мая 1946 командир отряда десантных судов бригады речных кораблей Дунайской флотилии.

За боевые отличия награжден: орденом Красного знамени, орденом Отечественной войны 2 степени, медалями "За оборону Советского Заполярье", "За победу над Германией в ВОВ 1941-1945г.г.", "За боевые заслуги".

Подвиг: За время отечественной войны показал волевые качества командира, сумел организовать и подготовить весь личный состав на отличное выполнение боевых заданий.

Катер, которым командует тов. Пономарев, находясь на ходу 3500 часов прошёл 15000 миль не имея ни одной аварии и поломки, как по корпусу, так и по механизмами. Катер подвергался неоднократно налёта вражеских самолётов. Умелым мпневром, огнём пулемёта и пушки все атаки отбивались успешно, причём катер не имел потерь в людях и технике. 

12 мая 1942 во время несения дозора был атакован тремя вражескими бомбардировщики "10-88". Атака была успешно отбита, один бомбардировщик был сбит.