Семнадцатилетним мальчишкой был призван в Красную Армию и направлен на учёбу в школу младших авиаспециалистов в город Новосибирск. После окончания младший сержант Михаил Мухин попал в 1-ю Воздушную Армию, дислоцирующуюся в подмосковном Серпухове, в запасной авиационный полк, где постигал азы мастерства, необходимые воздушному стрелку-радисту. И уже в этом же году принимал активное участие в боях на территории Восточной Пруссии. Самолёт ПЕ-2, известный более как «пикирующий бомбардировщик», на котором летал Михаил Афанасьевич, совершал рейды по вражеским тылам.

Весну 45-го года он встретил там же, в Восточной Пруссии, но ещё долго, вплоть до 1950 года, проходил службу в лётных частях.

Имеет воинские награды: орден Отечественной войны I степени, медаль «За победу над фашисткой Германией», многочисленные юбилейные медали.