Война застала  Михаила в Хабаровске, где он проходил срочную службу. В 1942 году часть направили на Западный фронт. Боевой путь Михаила Афанасьевича начался от станции Лиски Воронежской области.

В боях за освобождение Киева сержант, командир отделения подрывников-минеров Михаил Мотуз награжден медалью «За отвагу» за разминирование немецкой авиабомбы.

При форсировании Днепра  за расчистку коридора для прохода советских войск через минное поле, награжден орденом Красной звезды.