Война  застала  Миюсова  Я.Р. в должности начальника штаба 38 отдельного зенитного дивизиона, и на пятый день войны  дивизион  вступил  в  бой,  отражая  налет  немецкой авиации на Москву. С дивизионом зенитных орудий в качестве его командира он участвовал в Сталинградской битве, в  сражении  на  Курской  дуге,  в боях  по  освобождению  Прибалтики, где особенно проявились его командирский талант и личное мужество. Далее он командовал отдельным 2013 зенитно-артиллерийским полком резерва главного командования. Полк состоял из 16 полуавтоматических пушек калибра 85мм и роты крупнокалиберных пулеметов калибра 12,7мм. В сентябре 1944 года полк участвовал в прорыве обороны немцев на Рижском направлении Латвии. За эти бои полк получил почетное наименование Рижский. В этих боях полку неоднократно приходилось разворачивать орудия на прямую наводку, отражая танковые атаки немцев.
За большие боевые заслуги Миюсов Я.Р. был награжден пятью  боевыми  орденами: Александра  Невского,  Боевого Красного  Знамени,  орденами  Отечественной  войны I  и II степени, Красной Звезды. И многими медалями.