Ранним утром 22 июня 1941 года она, и ещё несколько семей офицеров,  смогли покунуть Брестскую крепость и все отправились на восток. Выжили не многие, но Атонина Михайловна с двумя своими детьми добралась до Вологды в  декабре 1941 года. Её родители сообщили зятю о том,что семья выжила и он прислал "Вызов" в Казахстан, где они и прожили всю войну - в степи, в землянках.В 1944 году она с детьми отправилась на Западную Украину - к мужу.