В 1944 г. после тяжелой контузии и осколочного ранения был признан инвалидом II группы и демобилизован. Состояние инвалида не устраивало юношу. Он упорно учился говорить и ходить, старался преодолеть свой недуг. И уже с 1945 года он продолжает учебу в Саратовском медицинском институте, который закончил с отличием в 1948 году. С этого же года поступает в клиническую ординатуру на кафедре инфекционных болезней того же института, по окончании которой в 1951 году был назначен ассистентом кафедры инфекционных болезней Новокузнецкого института усовершенствования врачей (Западная Сибирь). В связи с вакантной должности заведующего этой кафедрой вскоре назначается исполняющим обязанности заведующего, а с 1956 года избирается официально на эту должность.

В 1953 году М. М. Лисковцев защитил кандидатскую диссертацию на тему «Серодиагностика тифо-паратифозных заболеваний», а в 1954 г. ему присуждается звание доцента. В эти годы его научная деятельность посвящена краевой патологии – клещевым риккетсиоз и энцефалит. С консультациями и лекциями он объездил все отдаленные уголки Западной Сибири. В 1963 М. М. Лисковцев защищает докторскую диссертацию «Клиника, диагностика, функциональная патология и лечение клещевого риккетсиоза Азии», и в 1964 году ему присвоено звание профессора. В этом же году он проходит по конкурсу и начинает работать на должности заведующего кафедрой инфекционных болезней Харьковского медицинского института.

На момент перехода на работу в Харьковский мединститут М. М. Лисковцев уже имел более 60 научных работ, в том числе монографию «Клещевой риккетсиоз» (1963 г.). Молодой энергичный профессор с первых дней работы в новой должности зарекомендовал себя как специалист высокой квалификации и широкой эрудиции, прекрасный лектор и организатор. Он был пунктуальным и работоспособным, чрезвычайно требовательным к себе и другим. С его приходом активизируется научная работа на кафедре, появляется новая аппаратура, в лаборатории разрабатываются современные биохимические методики (изучение электролитов крови, нуклеиновых кислот, гистамина), впервые используются функциональные методы исследования в инфекционных больных (электрокардиографические, осциллографические и баллистокардиографические). За 5 лет его работы на кафедре было запланировано 5 кандидатских диссертаций, из которых 4 были защищены. Значительное внимание в этот период уделяется улучшению педагогического процесса. С целью повышения теоретического и практического уровней знаний студентов VI курсов впервые начали проводиться научно-практические конференции в студенческих группах.

Семья М. М. Лисковцева была типично «медицинской». Врачом была его жена Татьяна Евгеньевна, которая училась с мужем на одном курсе. Впоследствии она тоже работала в Харьковском медицинском институте в должности ассистента кафедры факультетской терапии (с 1964 по 1970 г.), а затем кардиологом в 20-й поликлинике Харькова. Врачами стали и две их дочери.

М. М. Лисковцев пользовался уважением и любовью среди сотрудников, которые сохранили теплую память о нем. Но надо отметить, что тяжелая контузия в годы войны наложила определенный отпечаток на особенности его характера, был несколько взрывным. В 1969 году М. М. Лисковцев при прохождении очередного конкурса не избирается на должность заведующего кафедрой. Он переезжает в г. Пермь, где возглавляет кафедру инфекционных болезней Пермского медицинского института. На этом посту Михаил Михайлович работал до самой смерти (до 1983 г.).