Окончил военное авиационное училище.

Служил в 79 бомбардировочном авиаполку.

Полк базировался на аэродроме Кировское (о.Сахалин).

В августе 1941г. перебазировался на аэродром в район Софийск (Хабаровский край).

В конце октября 1943г.  летчики: Аносов Григорий Павлович, Лукьяненко Яков Михайлович, Олихневич Деомид Григорьевич, Халуев Василий Иванович; летнабы (летчики-наблюдатели): Данилов Анатолий Иванович, Левин Александр Семенович, Пирогов Петр Афанасьевич; воздушные стрелки-радисты Еникеев Рахмед Гарифович, Лузан Федор Федорович, Яковлев Иван Тихонович- были направлены из 79 бомбардировочного авиаполка в Военное авиационное училище разведчиков ВВС Красной Армии (ВАУР), г.Давлеканово (Башкирия). В училище готовили экипажи самолетов-разведчиков.

После окончания училища Яков Михайлович был направлены в состав 48 гвардейского авиаполка дальних разведчиков.

К началу сентября 1944г. гвардии старший лейтенант Лукьяненко совершил 12 успешных боевых вылетов. Был представлен к ордену Отечественной войны II степени. Приказ о награждении от 03 декабря 1944г.

Назначен командиром звена 1-й авиаэскадрильи.

К концу апреля 1945г. Яков Михайлович совершил 36 успешных боевых вылетов на самолетах Пе-2 и Пе-3. Был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 16 июня 1945г.

Награжден медалями «За взятие Будапешта», «За взятие Вены», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

За долголетнюю и безупречную службу в 1946г. был награжден медалью «За боевые заслуги», в 1951г.- орденом Красной Звезды, в 1956г.- орденом Красного Знамени.

Гвардии подполковник Лукьяненко был уволен в запас 25 января 1956г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны I степени.