В составе 10 тяжелого бомбардировочного авиаполка участвовал в советско-японском вооруженном конфликте у озера Хасан в 1938г. Степан Иванович совершил один боевой вылет.

В составе 6 дальнего бомбардировочного авиаполка участвовал в советско-финской войне. С аэродрома Кричевцы (под Новгородом) совершил 3 боевых вылета на самолете ДБ-3.

С марта 1940г. полк базировался в Закавказье на аэродроме Евлах.

В начале августа 1941г. на базе полка был сформирован 453 дальний бомбардировочный авиаполк. Имел на вооружении самолеты ДБ-3.

С 25 августа участвовал в Иранской компании. Степан Иванович совершил 4 боевых вылета.

В начале декабря перебазировался на аэродром Кореновская (под Краснодаром). Вел боевую работу в Крыму.

С 15 декабря 1941г. по 10 мая 1942г. летчик Кожинов совершил 12 боевых вылетов на бомбардировку войск противника, 5 из них- ночью.

Вероятно, был ранен.

09 июля 1942г. старший лейтенант Кажинов выписан из эвакогоспиталя ЭГ 378.

К сентябрю 1942г. в составе 4 дальнего разведывательного авиационного полка (командир полка майор Берман Семен Давидович, военком- батальонный комиссар Артемьев Борис Павлович).

На вооружении полк имел самолеты Пе-2, Пе-3, с лета 1942г.-  американские самолеты «Аэрокобра».

Николай Никитович воздушный стрелок-радист 2-й авиаэскадрилья полка (командир старший лейтенант Колодяжный Сергей Амвросиевич). 

На базе эскадрильи была сформирована оперативная группа полка, которая действовала с оперативного аэродрома Добринка (Тамбовская обл.) в интересах Юго-Западного и Степного фронтов. В 1942г. группой руководил старший лейтенант Гаврилов Дмитрий Дмитриевич.

Экипаж самолета Пе-2: командир звена- Кожинов Степан Иванович, летнаб (летчик-наблюдатель) старший Павлов Иван Павлович, воздушный стрелок-радист Жириков Федор Прокопьевич. Самолет обслуживали: техник авиационный звена Барилов Алексей Степанович, механик авиационный старший Петухов Анатолий Николаевич, моторист авиационный Евграфов Иван Андреевич.

К средине января 1943г. старший лейтенант Кожинов совершил 18 боевых вылетов на разведку.

Известные даты вылетов: 05, 26., 27 октября, 04. 08, 11, 13, 16, 28 ноября. 13, 27, 28 декабря 1942г..

Был представлен к ордену Красного Знамени, приказом от 28 января 1943г. награжден орденом Отечественной войны II степени.

В январе 1943г. командование полком принял подполковник Артемьев Борис Павлович.

К марту 1943г. Степан Иванович в составе 1-й авиаэскадрильи полка. Командир эскадрильи- капитан Плитка Григорий Саввич. Оперативная группа полка а составе 1 авиаэскадрильи базировалась на аэродроме Курск-Центральный. Командовал группой гвардии майор Дмитриев Павел Дмитриевич.

18 марта 1943г. экипаж Степана Ивановича выполнил фотографирование Киева.

Выполнил фотографирование Курска.

29 марта экипаж: летчик капитан Кожинов, штурман старший лейтенант Ковальчук Николай Евствфьевич,  воздушный стрелок-радист старший сержант Макаров Леонид Петрович- в 09-15 вылетел на разведку погоды в район Мало-Архангельск- Тросна. Из-за сплошной обласности на маршруте, вернулся через 45мин. В 14-25 вновь вылетел в тот же район. Из Воронец и Тросна был обстрелян зенитной артиллерией, потеряв ориентировку, вернулся через 1ч 05мин.

05 апреля экипаж самолета Пе2 №6: летчик Кожинов, штурман эскадрильи капитан Степин Кузьма Иванович, стрелок-радист Макаров- выполнил разведку районов Навля- Брянск- Почеп- Трубчевск.

14 апреля экипаж Кожинов, Степин, Макаров выполнил площадное фотографирование района Севск- Брянцево. Вторым вылетом сфотографировал линию обороны противника на участке Новоямское- Морево.

15 апреля с пятью заходами выполнил площадное фотографирование района Рыльск- Краснооктябрьское.

24 апреля экипаж Кожинов, Ковальчук, Макаров выполнил фотографирование районов Котовка- Червяк- Знаменский- Тросна.

29 апреля выполнил разведку погоды Комаричи- Брянск- Почеп- Севск.

К концу апреля 1943г. командир звена 1 авиаэскадрильи полка (командир эскадрильи гвардии майор Плитка Григорий Саввич) капитан Кожинов совершил 26 успешных боевых вылетов на разведку.

Приказом от 26 мая 1943г. был награжден орденом Красного Знамени.

14 мая экипаж: летчик Кожинов, штурман старший лейтенант Павлов Иван Павлович, стрелок-радист Макаров- выполнил разведку районов Хутор Михайловский- Унеча- Стародуб- Новгород-Северский- Шостка.

14 июня экипаж летчик Кожинов, штурман лейтенант Беличенко Виктор Павлович, стрелок-радист Макаров- выполнил разведку районов Дмитровск-Орловский- Карачев- Брянск.

16 июня экипаж Кожинов, Беличенко, Макаров выполнил разведку в районе Рыльск- Глухов.

17 июня 1943г. полк был преобразован в 98 отдельный гвардейский разведывательный авиаполк. 

20 июня экипаж Кожинов, Беличенко, Макаров выполнил разведку в районе Белгород- Харьков.

21 июня- в районах Курск- Севск- Эсмань- Глухов.

26 июня экипаж Кожинов, Павлов, Макаров вылетел на разведку района Белгород- Харьков. У Белгорода был атакован парой истребителей Ме-110 (Мессершмитт). Уходя от преследования и получив повреждения самолета, экипаж выполнил посадку на аэродроме Воронеж. Вернулся в Курск 27 июня.

02 июля 1943г. экипаж: гвардии капитан Кожинов, старший летнаб (летчик-наблюдатель) старший лейтенант Павлов, воздушный стрелок-радист гвардии старший сержант Макаров- на самолете Пе-2 №38 выполнил полет в район Новгород-Северский с целью разведки погоды.

03 июля экипаж Кожинов, Павлов, стрелок-радист гвардии старший сержант Разиньков Семен Петрович- выполнил фотографирование железнодорожных узлов по маршруту Золочев- Белгород.

04 июля экипаж Кожинов- Павлов- Разиньков выполнил разведку района Брянск- Карачев.

10 июля экипаж самолета Пе-3 №30 Кожинов- Павлов выполнил разведку района Гомель- Унеча.

16 июля экипаж самолета Пе-3 №34 Кожинов- Павлов выполнил разведку и фотографирование района Гомель- Новозыбков.

17 июля- района Гомель.

18 июля- района Бахмач- Гомель- Новозыбков.

22 июля 1943г. экипаж: летчик гвардии капитан Кожинов Степан Иванович, штурман эскадрильи гвардии капитан Степин Кузьма Иванович, воздушный стрелок-радист  гвардии старший сержант Макаров Леонид Петрович на самолете Пе2 бортовой №46 произвел разведку по маршруту Севск- Почеп- Выгоничи.

23 июля 1943г. экипаж Кожинов- Степин- Макаров выполнил задание во аэроразведке.

26 июля экипаж Кожинов- Павлов- Макаров выполнил разведку района Сумы- Хутор Михайловский- Суземка.

30 июля экипаж Кожинов- Павлов- Макаров выполнил разведку района Трубчевск- Почеп- Хутор Михайловский.

01 августа 1943г. экипаж Кожинов- Степин на самолете Пе-3 выполнил разведку по маршруту Рыльск- Глухов- Кролевец.

02 августа экипаж Кожинов- Павлов- Макаров выполнил разведку района Ромны- Ворожба.

03 августа 1943г. экипаж Кожинов- Степин- Разиньков задание по разведке выполнил частично.

09 августа 1943г. экипаж Кожинов- Степин выполнил разведку района Конотоп- Гомель- Новозыбков- Новгород Северский. 

15 августа- Чернигов- Прилуки- Городище- Ромны (с 05-20 до 08-10, продолжительность полета 2ч. 50мин.).

19 августа экипаж Кожинов- Павлов выполнил разведку района Новгород-Северский- Новозыбков- Жлобин- Гомель.

22 августа экипаж Кожинов, Павлов, стрелок-радист гвардии старший сержант Кулагин Федор Михайлович выполнил разведку погоды в районе Рыльск- Глухов- Суземка.

23 августа экипаж Кожинов, Павлов выполнил разведку района Гомель- Новозыбков.

25 августа на самолете Пе-3 №34 экипаж: летчик гвардии капитан Кожинов Степан Иванович, летнаб гвардии старший лейтенант Артемов Александр Михайлович с аэродрома Курск вылетел на разведку района Жихов- Хутор Михайловский. Задание было выполнено частично- экипаж был атакован истребителями противника, прикрываясь огнем пулеметов, вернулся на свою территорию.

26 августа экипаж Кожинов- Артемов на самолете Пе-3 №20 выполнил разведку района Жухов- Стародуб- Новгород Северский- Шостка.

27 августа экипаж Кожинов- Артемов на самолете Пе-3 №31 выполнил разведку района Хутор Михайловский- Глухов- Рыльск.

31 августа экипаж Кожинов- Артемов на самолете Пе-3 №31 выполнил поставленную задачу.

01 сентября экипаж летчик Кожинов, летнаб гвардии старший лейтенант Крапивников Сергей Тимофеевич выполнил разведку района Суземка- Новгород Северский- Кролевец.

02 сентября 1943г. первым вылетом экипаж Кожинов- Артемов выполнил разведку района Гомель.

03 сентября экипаж Кожинов- Артемов вернулся с маршрута из-за плохих метеоусловий.

04 сентября 1943г. экипаж: летчик Кожинов, летнаб старший гвардии старший лейтенант Ковальчук Николай Евстафьевич, воздушный стрелок-радист гвардии старший сержант Жириков Федор Прокопьевич выполнил разведку района Конотоп- Путивль.

Вторым вылетом экипаж Кожинов- Артемов выполнил разведку района Киев, площадную съемку участка рек Десна и Сейм.

06 сентября экипаж Кожинов- Артемов выполнил разведку района Нежин- Киев.

Следующие боевые вылет экипаж Кожинов- Артемов совершил 07, 09, 10, 19 сентября.

08 сентября Степан Иванович и гвардии младший лейтенант Козик Александр Петрович в районе Бахмач был атакован тройкой истребителей ФВ-190 (Фокке-Вульф). Отстреливаясь, уходил от преследователей пикированием, во время которого слетел колпак кабины пилота. Истребители преследовали экипаж до Путивля.

12 сентября экипаж Кожинов- Павлов, взлетев с аэродрома Кагановка, выполнил разведку района Унеча- Клинцы- Новозыбков- Новгород-Северский.

13 сентября экипаж Кожинов- Павлов выполнил разведку района Климов- Клинцы- Новозыбков

14 сентября, экипаж Кожинов- Артемов, вылетев в район Льгов- Киев, был атакован истребителями противника. Вернулся на свой аэродром.

24 сентября экипаж самолета Пе-2 №32: летчик Кожинов, летнаб Артемов, стрелок-радист гвардии старший сержант Абакумов Иван Архипович- взлетев с аэродрома Конотоп, выполнили разведку погоды.

Следующие боевые вылет экипаж совершил 25 сентября.

26 сентября экипаж Кожинов- Артемов- Макаров выполнил задание.

19 октября экипаж Кожинов- Артемов выполнил разведку района Знаменка- Белая Церковь- Фастов- Киев.

21 октября- разведку аэродромов противника по маршруту Каменка- Смела- Ротмистровка- Белая Церковь.

Награжден медалью «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

Уволен в запас 02 апреля 1964г.