С 22 июня 1942 года проходил службу  в должности заместителя начальника политотдела 4 Гв. Зенитной Артиллерийской Киевской Краснознаменной ордена Богдана Хмельницкого дивизии РГК. Неустанно руководя партийными организациями дивизии, умело направлял коммунистов на выполнение боевых заданий и воспитывал в личном составе мужество, отвагу и преданность Родине.

За период наступательных боев в январе 1945 года находился в частях соединения. 17 января попал под обстрел немецких автоматчиков при поддержке танковых и самоходных орудий. При решительном отпоре врагу, благодаря его находчивости и мужеству, было сохранено гвардейское Красное Знамя полка.

Тов. Колодкин С. И. руководил личным составом и участвовал в боях, действуя с 3-й батареей 263 Гв. ЗАП, входившей в состав передового отряда, уничтожил 3 немецких бронетранспортера и до 100 гитлеровцев. За период этих боев дивизией уничтожено 13 немецких самолетов, 19 бронетранспортеров и до 1000 немецких солдат и офицеров.

За проявленное мужество и личную отвагу в борьбе с врагом награжден орденом Красного Знамени.

Участвовал в боевых операциях по форсированию Днепра, овладению г. Ландсберг, за выход к Балтийскому морю, за освобождение г. Гнезно, за взятие Берлина и др. Награжден орденами,медалями, почетными грамотами и ценными подарками.

Закончил войну в звании Гвардии майора.