В 1943 ушел в партизаны и попал в партизанский отряд Яна Налепки. Выдали оружие и вместе с чехами ходил выполнять задания которые поручал отряду командывание партизанского соединения генерала Сабурова. Учавствовал в освобождении города Овруч. В город входили ночью. В этом бою погибли Ян Налепко и еще пять партизан. За бои в партизанском отряде осталось ранение в ногу, с трудом удалось переправиться через линию фронта и попасть в госпиталь города Сарны. Затем был направлен в Киев,  там лечился д еля 1944 года. После госпиталя его зачислии в ряды красной армии и направили на фронт. До передовой доберался пешком, по пути встретил своего брата, который тоже был партизаном. Продолжать войну пришлось в саперной части. Вместе со старшими товарищами рядовому Карпунцу предстояло создавать условия для бесприпятсвенному продвижению к Берлину артилерии, танков, пехотных частей. Поэтому их то и дело перебрасывали с одного участка наступления на другой, то требовалось пантонный мост через реку навести, то на лодках переправить на другой берег штабистов. Отступая немцы взрывали мосты, минировали подступы к ним. Сапер и жизнью рисковал и был постоянно мокрый. Не всегда удавалось просушить портянки или в блиндаже выпить кружку чая. Осуществлял переправу через Вислу и Одер. За обеспечение успешного форсирования Вислы Николай Карпунец получил высокую правительственную награду орден Красной Звезды. Через две недели форсировали Одер, вторая награда Николая орден Славы третьей степени, а перед окончании войны наградили орденом Отечественной войны второй степени. После войны продолжил службу сержантом г. Вышний Волочек до 1953г.