Служил в Красной Армии с октября 1933г.

Был уволен в запас.

Призван в сентябре 1942г. по мобилизации из системы ГВФ (Гражданского воздушного флота).

Служил в составе 4 отдельного авиаполка ГВФ особой Северной авиационной группы ГВФ.

Совершил 31 боевой вылет ночью на самолете У-2.

Награжден медалью «За оборону Ленинграда».

В апреле 1943г, из экипажей 1, 2, 3 и 4 отдельных авиаполков ГВФ были сформированы 15. 16 и 17 ночные бомбардировочные авиаполки. 17 авиаполк формировался на аэродроме Едрово (Вышний Волочек). Командиром полка был назначен майор Боровков Николай Андрианович.

Алексей Михайлович был зачислен в состав полка.

К маю сформированные полки вошли в состав 213 ночной бомбардировочной авиадивизии.

Личный состав полка занимался боевой подготовкой.

В ночь на 11 июля с аэродрома Акатово одиночными самолетами бомбардировал войска противника в районе Перестряж. 27 самолетов У-2 совершили 41 боевой вылет, потерь нет.

В 1943г. полк впервые массово применил ампулы АЖ-2 с жидкостью «КС», поджигая опорные пункты противника. 

Участвовал в Спас-Деменской, Орловской и Смоленской операциях.

Экипажи полка доставляли грузы в партизанские отряды Нарчук, Шкредо, Садчикова, Гришина, Кирпич и Новикова.

К сентябрю 1943г. младший лейтенант Исаев совершил 49 боевых вылетов. Был представлен к ордену Отечественной войны II степени. Приказом от 21 сентября 1943г. награжден орденом Красной Звезды.

В ночь с 19 на 20 октября выполнил 2 боевых вылета со штурманом старшим лейтенантом Княгиничевым Владимиром Павловичем (данные из полетной книжки Княгинечева В.П.).

С 08 на 09 ноября экипаж выполнил разведывательный вылет с попутной бомбардировкой.

В 1944г. полк участвовал в Оршанско-Витебской, Вильнюсской и Каунасской операциях, бомбардировал позиции противника в Восточной Пруссии.

30 апреля 1944г. в районе Смоляны самолет лейтенанта Исаева на высоте 1000м. был атакован истребителем Ю-88 (Юнкерс). В результате атаки перебиты два лонжерона правой нижней плоскости. Экипаж невредим.

В 1945г. полк в составе дивизии участвовал в разгроме Восточно-Прусской группировки противника, бомбардировал гарнизон Кенигсберга.

Лейтенант Исаев был назначен пилотом звена связи Управления 213 ночной бомбардировочной авиадивизии.

Совершил еще 90 боевых вылетов и 210 вылетов по вопросам связи с передовыми частями.

Приказом от 17 февраля 1945г. был награжден орденом Отечественной войны II степени.

В апреле экипажи дивизии бомбардировал военно-промышленные объекты противника в порту Пиллау.

В последние недели войны- войска противника на Земландском полуострове и косе Фрише-Нерунг (Вислинская коса). 

Алексей Михайлович за долголетнюю и безупречную службу в апреле 1945г. был награжден медалью «За боевые заслуги», в 1954г.

Награжден медалями «За взятие Берлина», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941–1945 гг.» .

Уволен в запас 10 июня 1946г.