Призван в армию 26 июня 1941 г.. Воевал в рядах 755 стрелкового полка 219 стрелковой дивизии Западного фронта. 7 сентября 1941 г. он был ранен разрывной пулей в боях за населенный пункт Сизипан Смоленской области, после чего его отправили в госпиталь на Урал. Ранение привело к инвалидности III степени – правая рука перестала двигаться. После признания негодным к службе в армии Семен Ефимович был снят с учета военнообязанных и работал объездным в колхозе в Воронежской области. В 1945 г. был награжден Орденом Славы III степени.