На фронте с апреля 1942г.

22 июня 1942г. был ранен.

После излечения в госпитале был направлен в 58 запасной стрелковый полк.

С 21 октября 1942г. в составе 1322 стрелкового полка 413 стрелковой дивизии.

Был ранен 12 марта 1943г.

17 июля 1943г. красноармеец Чаплыгин был выписан из военного госпиталя ВГ 445 и направлен в 202 запасной стрелковый полк. 

03 августа 1943г. в команде военнослужащих (в состав команды входили также бывшие партизаны) был направлен из 202 запасного стрелкового полка в 152 укрепленный район.

Назначен заместителем командира отделения (расчета) 50-мм миномета 164 отдельного пулеметно-артиллерийского батальона (ОПАБ) 152 укрепленного района (УР).

К 20 августа части укрепрайона занимали оборону вдоль восточного берега р.Днепр и впадавшей в него р.Осьма, восточнее г.Дорогобуж. Перейдя в наступление 152 УР в составе семи ОПАБов овладел г.Дорогобуж (освобожден 01 сентября), принимал участие в боях по освобождению Смоленска (освобожден 25 сентября).

В боях Савелий Иванович огнем миномета подавил 2 пулеметные точки противника. 

Приказом от 12 января 1944г. младший сержант Чаплыгин был награжден медалью «За отвагу».

С 12 октября 1943г. части 152 укрепленного района занимали рубеж обороны юго-восточнее Бабиновичи, по восточному берегу рек Верхита, Черница.

Савелий Иванович был назначен заместителем командира отделения (расчета) 82-мм миномета.

С 23 июня 1944 части перешли наступление в составе 11 гвардейской армии, совместно с 31 армией.

При прорыве обороны противника младший сержант Чаплыгин был дважды легко ранен, но не покинул огневой позиции, уничтожив более 10 гитлеровцев.

Был представлен к ордену Красной Звезды. Приказом от 27 июля 1944г. был награжден орденом Славы III степени.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны I степени.