В 1940 году Иван Алексеевич был призван в армию, отслужив год срочной службы - началась война. Многие километры прошагал пехотинец Бубнов в составе Украинских и Белорусских фронтов, куда только не бросала его судьба. Были и победы, и поражения. Неизменным оставался лишь боевой дух солдата. Даже после второго серьезного ранения, он не потерял веру в свои силы, и после лечения в госпитале, пройдя курсы, сменил пехоту на авиацию, став воздушным стрелком.

Самолеты, на которых он летал, бомбили Восточную Пруссию, города Кенигсберг, Любау, Берлин.

Разгромом фашистов война не закончилась для Ивана Алексеевича - его авиаполк направляют на войну с Японией. Но и после окончания второй мировой войны, он еще продолжал служить в армии и домой вернулся только в 1947 году.