Екатерина родилась 7 декабря 1922 года в селе Федосеевка Старооскольского района. В семье было 5 детей, Катя вторая.

В 1942 году вместе с отступающими из Старого Оскола частями из Красной Армии Екатерина, её младшая сестра и подруга Аня Фаустова ушли на фронт. Девушки попали в 762-й батальон аэродромного обслуживания (БАО) 2-й Воздушной армии. Сначала Екатерина работала делопроизводителем, а затем машинисткой в штабе.

За участие в ВОВ Екатерина Бондаренко награждена медалью "За боевые заслуги", юбилейными медалями.