В 1939 году был призван в ряды Красной Армии. Здесь его и застала война. Закончил курсы "Выстрел" в г.Ташкенте, получил звание младшего лейтенанта. Прошел всю войну и  был командиром роты связи, имел звание старшего лейтенанта. Участвовал в различных сражениях на территории нашей Родины, освобождал Польшу, Германию, штурмовал Берлин. За годы войны фронтовик получил тяжёлые ранения и стал инвалидом второй группы. За героизм и мужество, проявленные в боях, был награждён орденами Красной Звезды за форсирование р.Одер,  орденом Отечественной войны II степени, медалями «За победу над Германией», «За взятие и штурм Берлина», «За участие и освобождение Варшавы».

После войны Степан Яковлевич зоочно оканчивает Минский педагогический институт, создаёт в 1949 году свою семью. Он трудиться в различных школах нашего района: в Виноровской школе преподаёт биологию, в Микуличской , Ягодской, Устянской школах является директором,  в Якшицкой - завучем.

Семейная жизнь слаживалась счастливо. Со своей супругой Степан Яковлевич воспитал двоих детей. Было у него одно увлечение на всю жизнь – поэзия. Его дети до сих пор хранят стихи, написанные им. Главная тема этих стихов – война.

12 августа 1995 года перестало биться сердце ветерана войны Бондаря Степана  Яковлевича. Похоронен в деревне Устье Березинского района.