В мае 1941 года был призван в ряды Советской Армии и зачислен в авиационную школу. Ему было 19 лет, когда началась Великая Отечественная война. Закончив авиационную школу в звании - старший сержант  Военно-воздушных сил,был направлен на фронт в 836 Бомбардировочный Авиационный Полк (836 БАП). Дедушка участвовал в операции по разгрому немецких войск на Воронежском направлении, Орловско-Курской операции, на Карельском перешейке, в боях под Нарвой и в Берлинской операции. Он был старшим стрелком радистом на бомбардировщике.

При операции под Орлом во время выполнения боевого вылета дедушка метким выстрелом сбил истребитель противника.

При выполнении одного из боевых заданий в 1942 году экипаж бомбардировщика был атакован группой истребителей противника, несмотря на полученное ранение, самоотверженно вел пулеметный огонь по врагу, и атаки были отбиты. Экипаж, выполнив боевое задание вернулся на свой аэродром.

За время Отечественной войны совершил более 30 боевых вылетов, отлично овладел стрелковым вооружением новой материальной части самолета Ту-2. Благодаря своей смекалке и внимательности в воздушных боях первым распознавал самолеты противника, а также непрерывно обеспечивал связь с землей и строем.

Согласно Приказа Военно-Воздушным силам Красной Армии № 038/н от 10 мая 1945 г. «О награждении личного состава»: «От имени Президиума Верховного Совета Союза ССР за образцовое выполнение боевых заданий командования на фронте, борьбы с немецкими захватчиками и проявленные при этом доблесть и мужество - награждаются:

Орденом Красного знамени

в том числе: старший сержант Баканов Андрей Никитович – воздушный стрелок-радист 836 Бомбардировочного авиационного полка.

После победы над Германией в мае 1945 года дедушка был направлен на Советско-Японскую войну. Он освобождал китайский город Харбин от японских захватчиков, за что был награжден медалью «За победу над Японией"