С начала ВОВ  Федор Иванович Ашмарин работал хирургом черепно-мозговых ранений в госпитале №3206 Краснодарского Края, а с  18 августа 1942 г в госпитале №2130. Доктор Ашмарин,оперируя часто без сна и отдыха  в течение нескольких суток подряд, всегда очень внимательно относился к больным. За 2 года войны, до награждения, он провел 1050 операций, из них 700 в госпитале №2130. Многие солдаты и командиры обязаны ему восстановлением после тяжелых ранений. наряду с основной работой оперирующего хирурга, он обучал молодых врачей. Читал курс полевой хирургии для врачей и среднего мед.персонала. проводил практические занятия  по гипсовой технике. Приказом от 25 апреля 1943 года награжден Орденом Красной Звезды. 

После окончания ВОВ Федор Иванович работал хирургом  в г.Краснодаре.