Окончил военную авиационную школу пилотов.

К июлю 1943г. воевал в составе 24 гвардейского ночного бомбардировочного авиаполка.

Экипажи полка участвовали в Курской битве

К средине февраля 1944г. гвардии младший лейтенант Аниховский совершил 94 боевых вылетов на самолете У-2, 62 из которых- успешные. Был представлен к ордену Красного Знамени, приказом от 14 апреля 1944г. награжден орденом Отечественной войны II степени.

Сергей Кононович прошел переучивание в 1 запасной штурмовой Краснознаменной авиабригаде (г.Куйбышев).

20 апреля 1944г. прибыл в состав 952 штурмового авиаполка 311 штурмовой авиадивизии. Командир полка майор Соловьев Иван Михайлович.

Части дивизии вели боевую работу на 3 Белорусском фронте.

В первые дни операции «Багратион»- при прорыве обороны противника и в боях за освобождение Витебска, летчик 1 авиаэскадрильи полка гвардии младший лейтенант Аниховский совершил 10 успешных боевых вылетов на штурмовике Ил-2  Летал с воздушным стрелком рядовым Ибраевым Михаилом Ибраевичем.

Приказом от 04 июля 1944г. Сергей Кононович был награжден орденом Красной Звезды.

09 июля 1944г. Сергей Кононович в группе из 6 самолетов Ил-2 (ведущий лейтенант Виноградов Борис Сергеевич) вылетел на уничтожение войск противника, отходящих по дороге Вильнюс- Рудзишки. В 10-40 северо-западнее Вильнюса группа встретила пару истребителей ФВ-190 (Фокке-Вульф). Стрелки-радисты, заметив истребители, подали сигнал красными ракетами. Лейтенант Виноградов по радии дал команду: «Уплотнить строй!». В момент разворота истребителей для атаки, воздушные стрелки Под прикрытием своего ведомого, ведущий истребитель с дистанции 100м. открыл огонь по крайнему ведомому группы штурмовиков. Прямым попаданием снаряда был убит воздушный стрелок младший сержант Кычков Илья Иванович, стрелок пятого ведомого- старший сержант Борисов Степан Яковлевич прицельной очередью подбил «фоккер», который, задымившись, резко отвернул в сторону и скрылся из вида. Второй истребитель последовал за ним. 

Группа, выйдя на цель, атаковала ее с трех заходов. Выполнив задание, возвратилась на свой аэродром.

Полк за отличие в боях по освобождению Орши получил почетное наименование «Оршанский». Участвовал в освобождении Вильнюса и Каунаса.

06 октября 1944г. началась Таурагская операция- войска 3 Белорусского фронта прорывали немецкую оборону западнее г.Расейняй (Литва). Экипажи полка наносили удары по противнику в направлениях Калнуи и Аукшталине.

К 11 ноября 1944г. гвардии лейтенант Аниковский совершил 31 успешный боевой вылет, был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 19 декабря 1944г.

13 января 1945г. началось наступление наших войск. Части 3 Белорусского фронта прорывали оборону противника на границе Восточной Пруссии, нанеся основной удар на Шталлупенском направлении (Шталлупен- совр. г.Нестеров, Калининградская обл.).

Полк базировался на аэродроме Калвария.

В период с 09-50 до 10-50 группа из 6 самолетов Ил-2 (ведущий- командир 1-й авиаэскадрильи капитан Каштанов Николай Павлович). Нанесла удар по артиллерийским позициям противника северо-западнее Шталлупен. На обратном маршруте группа попала в туман. Экипаж: гвардии старший лейтенант Аниховский, воздушный стрелок Жеребченко Семен Сидорович, произвел посадку на аэродроме Повицы.

К средине февраля 1945г. командир звена гвардии старший лейтенант Аниховский совершил 52 успешных боевых вылетов. Был представлен к ордену Отечественной войны I степени. Приказ о награждении от 12 марта 1945г.

23 апреля 1945г. Сергей Кононович был представлен к ордену Красного Знамени. Приказ о награждении от 18 мая 1945г.

Последний боевой вылет экипажи полка совершили 08 мая 1945г. в район севернее г.Тигенхоф, Восточная Пруссия (совр. Новы-Двур-Гданьский, Польша).

24 июня 1945г. Сергей Кононович участвовал в Параде Победы на Красной площади.

Награжден медалями «За взятие Кенигсберга», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

Гвардии майор Аниховский был уволен в запас 20 июня 1960г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны II степени.