Евгений Федорович Агеенко родился 14 января 1893 года в г. Сураже в многодетной семье мелкого служащего земельной управы, русский. После окончания городского училища поступил в Суражскую учительскую семинарию, которую окончил в 1913 году первым выпуском и получил диплом №1. Был назначен учителем в г. Гринев Стародубского уезда. В 1914 году поступил в Калужский учительский  институт, где проучился до января 1917 года и был направлен в Киевское военное училище, которое по ускоренной программе окончил в мае 1917 года, получив звание прапорщик. Из училища убыл в дислоцированный в Екатеринбурге (Свердловске)  пехотный полк на должность командира взвода.

После победы Октябрьской революции его полк был расформирован в декабре 1917 года, и Евгений Федорович, демобилизовавшись,  вернулся в Сураж. Работал учителем до мая 1918 года. Потом вступил добровольцем в Красную Армию и работал в Суражском военкомате, а затем помощником коменданта г. Суража. В июне 1919 г. был направлен в г. Симбирск (Ульяновск) в распоряжение штаба Восточного фронта. Затем был направлен на Южный фронт в качестве командира батальона 74 полка 9 стрелковой дивизии. В сражении против деникинской армии в ноябре 1919 года за операцию по захвату обоза с оружием был награжден орденом Красного Знамени (№3). В марте 1920 года был назначен командиром 74 полка, который принимал участие  в разгроме Врангеля в боях на Перекопе и в Крыму. За время пребывания в должности командира полка трижды награжден наручными часами с выгравированной надписью “Честному воину Красной Армии от Петроградского Совета рабочих и крестьянских депутатов”.

В декабре 1920 года был демобилизован из рядов Красной Армии по ранению и болезни. В 1921 году женился на Царенко Ольге Георгиевне, имел двух дочерей  Светлана 1924 г.р. и Маргарита 1928 г.р. С февраля 1921 по 1923 год работал в Клинцовском военкомате. С 1923 г. по июнь 1941 работал учителем географии и рисования в школах Суража, с 1931 года – завучем в средней школе №1.

22 июня 1941г. убыл в Смоленск, в штаб Белорусского военного округа, где был назначен помощником начальника оперативного отдела штаба 20-й армии  в воинском звании капитан. В составе этой армии участвовал в обороне Москвы. В марте 1943 года был назначен на должность помощника начальника оперативного отдела  штаба Западного фронта, в последствии переименованного в 3-й Белорусский фронт. В этой должности в звании подполковника закончил войну в Кенигсберге. Уволен в запас в декабре 1945 года.

За время Великой Отечественной войны был награжден орденами Отечественной войны 1 и 2 степени, медалями “За отвагу”, “За оборону Москвы”, “За взятие Кенигсберга”, “За победу над Германией”.

После войны с января 1946 по июль 1952 года работал директором Суражской средней школы №1, потом два года преподавателем  географии этой же школы. За преподавательскую деятельность был награжден орденом “Знак почета”. Неоднократно избирался депутатом районного и городского Советов народных депутатов, вел большую общественную и краеведческую работу. Умер 30 марта 1959 г., похоронен в г. Сураже.