В августе 1945 г. Абрамов Борис Сергеевич был назначен  инспектором контроллером больниц и госпиталей при Санотделе Центральной военной комендатуре Советского сектора города Берлина. 

В это время г. Берлин был разделен на 4 сектора: американский, английский, французский и советский. Обеды в Центральной военной комендатуре для руководящего состава секторов были совместными. Интересен тот факт, что обеды готовились поочередно, поварами всех секторов. Деда рассказывал, что все очень радовались, когда угощали русскими обедами, они были хлебосольнее других. 

В марте 1947 г. после настоятельных просьб, деда был переведен на лечебную работу начальником инфекционного отделения Госпиталя Центральной Военной Комендатуры Советского сектора г. Берлина. В ноябре 1947 г.  он был назначен  заместителем начальника Центрального Штабного Госпиталя СВАГ по медицинской части. В конце 1947 г. Абрамов Борис Сергеевич получает звание подполковника медицинской службы. 

В феврале 1948 г. Абрамов Борис Сергеевич возвращается на родину.

19 мая 1956 г. приказом Министра Обороны СССР №02198 Абрамову Борису Сергеевичу было присвоено звание «Полковника медицинской службы». Служба в СЭО продолжалась до 1961 г. и была сопряжена с постоянными командировками в «горячие» точки Узбекистана  для ликвидации эпидемий чумы, холеры и прочих опасных инфекций среди населения.

Сразу после демобилизации в 1961 г. из Вооруженных Сил СССР Абрамов Борис Сергеевич начал преподавать на кафедре Эпидемиологии Ташкентского государственного института усовершенствования врачей. В мае 1970 г. его пригласили в Минздрав УзССР на должность Главного эпидемиолога Республики. С этого времени он совмещает работу  Главного эпидемиолога и старшего преподавателя Ташкентского государственного института усовершенствования врачей, где и работает до выхода на заслуженный отдых.