Подполковник.Начальник штаба 319 гсп 44 гсд.
Родился 28 января 1902 г. в г.Вологда Вологодской области в семье путевого обходчика. Кроме Алексея в семье было еще четверо детей: три брата и сестра. Рано оставшись без отца, начал работать, кормил семью.
В 1919 г. добровольно вступил в Красную Армию. Участвовал в боях Гражданской войны.
В 1920 г проходил военную службу в штабе 147-го отдельного стрелкового батальона ВОХР, откуда был направлен на учебу в Рязанское пехотное училище.
В 1925 г. окончил училище и направлен служить в г. Канск Красноярского края, куда прибыл уже вместе с женой - Шарлыгиной Анастасией Степановной.
В 1929-1930 гг. убыл к новому месту службы - на Дальний Восток в Приморский край, город Никольск-Уссурийский, где проходил службу в 76-м стрелковом полку. В составе полка участвовал в боях с Японской армией во время военных конфликтов на КВЖД, Халхин-Голе, озере Хасан.
В 1939-1940 гг. переведен к новому месту службы - г.Бобров Воронежской области.
В начале 1941 г. назначен начальником штаба вновь формируемого полка в составе 44-й стрелковой дивизии КОВО.
С апреля 1941 г. формирует 319-й горнострелковый полк в составе 44-й горнострелковой дивизии (н.п.Выгода Станиславской обл.).
В составе 319 гсп 44 гсд участвует в боях Отечественной войны с 22.06.1941 г. по 7 августа 1941 г., когда дивизия погибла в окружении восточнее г. Умань. Из окружения вышел.
Воевал. 18.08.1941 г. был тяжело ранен в лицо. Эвакуирован в тыловой госпиталь.
После излечения вновь в действующей армии. В 1942 г. - начальник штаба 591 сп 176 сд Закавказского фронта.
В боях под Развильное 2.8.1942 г. батальоны полка были окружены танками и пехотой противника. Оставаясь с батальонами, майор Шарлыгин, проявляя настойчивость и упорство в организации выхода из окружения, и в течение 20-ти суток выводил батальоны с боями, одновременно нанося противнику потери в живой силе и технике. В результате 1-й, 2-й стрелковые батальоны и минбатальон были выведены из окружения с материальной частью и вооружением. (ЦАМО. ф.33, оп. 682525, д.195, л.219).
С 17.09.1942 г. по 18.01.1943 г. - командир 545-го стрелкового полка 389-й стрелковой дивизии.
В 1944 г. - прошел обучение на Курсах усовершенствования командирского состава РККА "Выстрел".
С 05.02.1945 г. - командир 274 сп 24-й Самаро-Ульяновской Бердичевской трижды Краснознамённой орденов Суворова и Богдана Хмельницкого Железной стрелковой дивизии 7-й Гвардейской армии 2-го Украинского фронта. Гвардии подполковник.
3.04.1945 г. в ходе боя подорвался на мине в районе гор. Святой Микулаж.
Умер от полученных ран 21.08.1945 г. в эвакогоспитале №3390 г.
Похоронен г. Пиештяны (Чехословакия) Южная часть города. Кладбище по ул. Братиславской "Новый цинториж". Восточная часть кладбища. 2-й ряд. Могила №3.
Перезахоронен Чехословакия, Братислава р-н, г. Братислава, военное кладбище Славин.

Награжден: Медаль XX лет РККА, Орден Красного Знамени; Орден Красной Звезды; Медаль "За отвагу"; Медаль "За боевые заслуги