Боевой путь начался с призыва на действительную воинскую службу в 1938 году (Тисульский райвоенкомат). Служить пришлось на восточных рубежах страны в артиллерийских войсках, часть дислоцировалась в городе Иман, нынешний Дальнереченск. В период службы в конце 1939 года направлен командованием в военно-политическое училище, в стенах которого с приближением войны готовили офицеров артиллерии. Начало войны встретил в Юго-Западной группе войск командиром батареи 122 мм гаубиц, державшим оборону на Южном направлении наступления немецких войск. В начале 1942 года при боевых наступательных операциях в районе Барвенково и Лозавой получил первое ранение. После госпиталя в составе 2 и 4 Украинских фронтов оборонял Сталинград, воевал на Курской Дуге. С переходом в наступленте Советских войск освобождал от фашистов территорию Украины, Польшу, Чехословакию. Весной 1945 года в бою за крупный стратегически важный район Чехословакии Моравская Острава получил второе ранение. Победу встретил в военном госпитале города, откуда после лечения был направлен в Прикарпатский военный округ. В связи с ухудшением здоровья после полученных ранений в 1947 году переведён в запас. Боевой путь старшего лейтенанта Руковишникова Я.П. отмечен пятью правительственными наградами: двумя орденами Великой Отечественной войны (1 и 2 степени) и тремя медалями за освобождение Европейских стран.