С июля 1942г. летчик в составе 2 авиационного полка дальних разведчиков. На вооружении полк имел самолеты Пе-2. Базировался на аэродроме Монино. Командир полка- подполковник Тюрин Трофим Романович.

08 февраля 1943г. полк был преобразован в 47 гвардейский авиационный полк дальних разведчиков.

При поступлении на вооружение самолетов Ту-2, Алексей Семенович переучился на новый тип самолетов.

Летал на разведку районов Рига, Каунас, Даугавпилс, Тарту, Вильно, Молодечно, Минск, Лепель, Невель, Борисов, Орша, Гомель, Могилев, Витебск, Смоленск.

Был назначен командиром звена.

Летом 1943г. руководил оперативной группой, состоявшей из 5 экипажей.

К средине августа 1943г. выполнил 23 боевых вылета, 14 из которых- на самолете Ту-2, 17 вылетов выполнено с оценкой «отлично».

Приказом от 04 сентября 1943г. гвардии капитан Дрыгин был награжден орденом Красного Знамени. 

Был назначен командиром эскадрильи.

К средине апреля 1944г. выполнил еще 14 боевых вылетов, 10 из которых- на «отлично».

Был представлен к ордену Красного Знамени, приказом от 30 апреля 1944г. награжден орденом Александра Невского.

К началу июля 1944г. выполнил еще 10 боевых вылетов.

Был представлен к ордену Красного Знамени, приказом от 21 июля 1944г. награжден орденом Отечественной войны I степени.

К 01 апреля 1945г. выполнил 16 успешных боевых вылетов на дальнюю развек.

Вел разведку в районах Берлин, Данциг, Гдыня, Кенигсберг, Штеттин, Свинемюнде, Бранденбург, Торн, Франкфурт-на-Одере, Лодзь, Кольберг и др.

Приказом от 30 апреля 1945г. командир 1 авиаэскадрильи полка гвардии майор Дрыгин был награжден вторым орденом Красного Знамени.

Награжден медалями «За взятие Кенигсберга», «За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг.».

За долголетнюю и безупречную службу в 1948г. был награжден медалью «За боевые заслуги», в 1954г.- орденом Красной Звезды.

Гвардии подполковник Дрыгин вышел в отставку 30 марта 1959г.

В честь 40-летия Победы награжден орденом Отечественной войны I степени.